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양도소득세최종 검토 2026-11-12

등록 전 임대차계약이 있던 주택, 임대 등록하면서 증액한 보증금도 5% 증액제한 위반인가

"2017⁠년에 전세를 놓은 집을 2018⁠년 초에 임대사업자로 등록했습니다. 등록하면서 새로 계약을 쓰고 보증금을 10% 올렸는데, 이게 5% 증액제한 위반이라 거주주택 비과세를 못 받는다는 말을 들었습니다." 소득세법 시행령의 5% 요건은 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 체결하거나 갱신한 계약분부터 적용합니다. 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전에 등록하면서 증액한 보증금은 비교 대상이 아니고 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 처음 체결⁠·⁠갱신한 계약이 기준 계약⁠이 됩니다. 다만 장기보유특별공제 특례는 기준 계약을 따로 정하므로 특례마다 나눠 판정합니다.

5% 요건은 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 계약분부터 적용합니다

거주주택 비과세 특례(소득세법 시행령 제155⁠조 제20⁠항)⁠와 다주택 중과배제(같은 영 제167⁠조의3 제1⁠항 제2⁠호)⁠는 장기임대주택의 임대보증금⁠·⁠임대료 증가율이 5%⁠를 넘지 않을 것을 요건으로 둡니다. 2019⁠년 2⁠월 11⁠일까지 시행된 조문에는 이 요건이 없었습니다. 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 개정으로 들어왔고 적용 시점은 부칙에 있습니다.

제154⁠조제1⁠항제4⁠호, 제155⁠조제20⁠항제2⁠호 및 제167⁠조의3⁠제1⁠항제2⁠호(제167⁠조의10⁠제1⁠항제2⁠호가 적용되는 경우를 포함한다)⁠의 개정규정은 이 영 시행 이후 주택 임대차계약을 체결하거나 기존 계약을 갱신하는 분부터 적용한다.

소득세법 시행령 부칙(대통령령 제29523⁠호, 2019.2.12.) 제6⁠조

이 부칙은 양도일이나 등록일이 아니라 임대차계약의 체결⁠·⁠갱신일을 기준으로 합니다.

국세청은 임대료 상한의 기준이 되는 최초의 계약을 "영 시행일 이후 최초로 체결한 표준임대차계약"으로 봅니다(서면-2020-부동산-3300, 2020.7.24.). 이 회신의 사실관계는 2018⁠년 2⁠월 임대차계약과 단기 임대 등록, 2020⁠년 1⁠월 표준임대차계약 체결 순서였습니다. 사실관계에 비추면 2020⁠년 1⁠월 표준임대차계약이 기준 계약입니다.

등록하면서 증액한 보증금은 비교 대상이 아닙니다

2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전에 등록하면서 등록 전 계약 보증금을 10% 증액했어도 소득세법 시행령의 5% 요건을 적용하지 않습니다⁠. 5% 비교는 기준 계약 다음 계약부터 합니다. 기준 계약 자체의 증액폭은 비교 대상으로 삼지 않습니다. 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 2018⁠년 이전 계약 대비 5%⁠를 넘겨 증액한 중과배제 질의에도 국세청은 시행일 이후 최초로 체결한 표준임대차계약을 기준 계약으로 답했습니다(서면-2021-법규재산-3399, 2022.11.23.). 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전 증액을 5% 위반으로 본 해석이나 심판례는 확인되지 않습니다.

조세심판원 결정도 같은 기준입니다. 청구인은 2017⁠년에 보증금을 증액했으므로 2020⁠년에는 증액이 없었다고 주장했습니다. 심판원은 2017⁠년 증액을 반영한 계약서가 확인되지 않는 점, 청구인이 지자체에 직접 제출한 2019⁠년 4⁠월 표준임대차계약서를 사실과 다르다고 볼 이유가 없는 점을 들어 이 주장을 배척했습니다. 2019⁠년 4⁠월 계약이 기준 계약이고 2020⁠년 2⁠월 계약의 보증금이 5%⁠를 넘겨 증액됐으므로 장기임대주택에 해당하지 않는다⁠고 결정했습니다(조심2022⁠서7263, 2023.1.4., 기각). 상급심 결과는 확인되지 않습니다.

기준 계약이 정해지면 그다음 갱신⁠·⁠신규 계약부터 직전 계약 대비 5% 이내⁠여야 합니다. 2020⁠년 2⁠월 11⁠일 이후 갱신하거나 새로 체결하는 계약분부터는 증액 후 1⁠년 안 재증액 금지를, 2020⁠년 2⁠월 11⁠일 이후 전환하는 분부터는 보증금⁠·⁠월세 전환 기준을 적용합니다(소득세법 시행령 부칙 제30395⁠호 제16⁠조).

2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 등록했다면

2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후에 등록한 주택은 해석이 나뉩니다⁠. 먼저 2019⁠년 7⁠월에 계약하고 9⁠월에 등록한 사안이 둘 있습니다. 거주주택 비과세 질의에 국세청은 앞선 회신(서면-2020-부동산-3300)⁠을 들어 영 시행일 이후 최초로 체결한 표준임대차계약을 기준으로 답했습니다(서면-2020-부동산-3664, 2021.2.3.). 종부세 합산배제 질의에서도 '19.2.12. 이후 최초로 체결 또는 갱신하는 표준임대차계약이 기준이었습니다(서면-2020-부동산-2435, 2020.10.26.).

반면 2019⁠년 10⁠월에 계약하고 같은 달 장기일반으로 등록한 사안에서는 장기일반민간임대주택으로 등록한 후 작성한 표준임대차계약을 기준으로 보았습니다(서면-2021-부동산-5682, 2023.4.19.). 거주주택 비과세 질의에 기존 해석사례(사전-2022-법규재산-0036)⁠를 들어 답한 회신도 있습니다(서면-2026-부동산-0443, 2026.6.25.). 그 해석사례는 등록한 후 최초로 작성한 표준임대차계약을 기준 계약으로 봅니다. 다만 서면-2026-부동산-0443⁠은 2019⁠년 2⁠월 1⁠일 등록 사안이어서 등록 후 첫 계약과 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 첫 계약이 같은 2021⁠년 1⁠월 계약이었습니다.

이런 주택은 등록 전 계약이 표준임대차계약인지, 등록 후 첫 계약이 언제인지⁠를 함께 확인합니다.

특례별 기준 계약

특례5% 판단의 기준 계약근거
거주주택 비과세, 다주택 중과배제2019.2.12. 이후 처음 체결⁠·⁠갱신한 표준임대차계약(2019.2.12. 이후 등록은 해석이 나뉨)소득세법 시행령 부칙 제29523⁠호 제6⁠조, 서면-2020-부동산-3300, 서면-2021-법규재산-3399
종부세 합산배제2019.2.12. 이후 처음 체결⁠·⁠갱신한 표준임대차계약(2019.2.12. 이후 등록은 해석이 나뉨)종합부동산세법 시행령 부칙 제29524⁠호 제3⁠조, 서면-2019-부동산-3588
장기보유특별공제 50%·⁠70% 특례장기일반민간임대주택으로 등록한 후 작성한 표준임대차계약조세특례제한법 제97⁠조의3 제1⁠항 제2⁠호, 서면-2020-부동산-1528

종부세 합산배제의 5% 요건도 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 개정으로 들어왔습니다. 2018⁠년 10⁠월 23⁠일 시행본 제3⁠조에는 증가율 요건이 없었습니다. 부칙에 따라 "이 영 시행 이후 주택 임대차계약을 갱신하거나 새로 체결하는 분부터" 적용합니다(종합부동산세법 시행령 부칙 제29524⁠호 제3⁠조). 2018⁠년 7⁠월 임대 뒤 2019⁠년 1⁠월 장기일반으로 등록한 사안에서 국세청은 '19.2.12. 이후 최초로 체결 또는 갱신하는 표준임대차계약을 기준으로 5% 초과 여부를 적용한다고 회신했습니다(서면-2019-부동산-3588, 2019.10.21.).

장기보유특별공제 특례는 사정이 다릅니다. 조세특례제한법 시행령 제97⁠조의3 제3⁠항 제1⁠호는 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전부터 '연 증가율 100⁠분의 5'를 요건으로 두었습니다. 이 요건에는 소득세법 시행령 부칙 제6⁠조 같은 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 계약일 적용례가 없고, 2020⁠년 2⁠월 11⁠일 개정분의 적용례만 있습니다(대통령령 제30390⁠호 부칙 제16⁠조). 국세청은 기준 계약을 준공공임대주택(현 장기일반민간임대주택)⁠으로 등록한 후 작성한 표준임대차계약으로 봅니다(서면-2020-부동산-1528, 2022.11.3.). 등록 전 계약은 이 특례에서도 기준이 아닙니다⁠.

단기 임대를 장기일반으로 변경 등록하려는 질의에는 기존 해석사례를 들어 답했습니다(서면-2020-부동산-0190, 2020.3.18.). 그 해석사례는 장기일반 등록 당시 존속 중인 표준임대차계약을 기준으로 봅니다. 변경 등록 시점에 존속하던 계약이 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전 계약이어도 이 특례에서는 그 금액이 기준⁠이 될 수 있으므로 따로 확인합니다.

가정 사례로 보면

등록 전 계약이 있던 집의 계약 흐름(가정)
  1. 2017.6.
    전세 3⁠억원 계약
    임대 등록 전
  2. 2018.3.
    임대사업자 등록, 같은 임차인과 새 계약 3⁠억 3⁠천만원
    10% 증액, 장기일반으로 등록
  3. 2019.2.12.
    소득세법⁠·⁠종부세법 시행령 5% 요건 시행
    이후 체결⁠·⁠갱신분부터
  4. 2020.3.
    갱신 3⁠억 6⁠천만원
    2019.2.12. 이후 첫 갱신, 약 9% 증액
  5. 2022.3.
    갱신
    2020.3. 계약 대비 5% 이내여야 함
특례2018.3. 10% 증액2020.3. 약 9% 증액
거주주택 비과세, 중과배제비교 대상 아님기준 계약이 되므로 비교 대상 아님, 2022.3. 갱신부터 5%
종부세 합산배제비교 대상 아님기준 계약, 2022.3. 갱신부터 5%
장기보유특별공제 특례등록 후 작성 계약이면 기준 계약2018.3. 계약 대비 5% 초과로 요건 미충족

같은 2020⁠년 갱신이 거주주택 비과세에서는 기준 계약⁠이 되고, 장기보유특별공제 특례에서는 5% 위반⁠이 됩니다. 2018⁠년 3⁠월 계약을 등록 후에 작성했다면 그 계약이, 등록 전에 작성했다면 등록 후 첫 계약이 장기보유특별공제 특례의 기준 계약입니다.

세법 요건과 과태료는 따로 봅니다

민간임대주택에 관한 특별법에도 5% 증액 제한이 있습니다. 2018⁠년 초 시행본은 "민간임대주택의 최초 임대료(임대보증금과 월임대료를 포함한다. 이하 같다)⁠는 임대사업자가 정한다"고 했습니다. 현행 민간임대주택법 제44⁠조 제1⁠항 제2⁠호 단서는 등록 당시 존속 중인 임대차계약의 임대료를 최초 임대료로 보는데, 이 단서는 2019⁠년 10⁠월 24⁠일 이후 최초로 등록하는 주택부터 적용합니다(법률 제16386⁠호 부칙 제4⁠조). 그래서 2018⁠년 등록하면서 새로 체결한 계약의 보증금은 조문상 최초 임대료⁠로 봅니다.

그 뒤 갱신부터는 민간임대주택법의 5% 제한을 받습니다. 가정 사례의 2020⁠년 3⁠월 약 9% 증액은 세법상 거주주택 비과세의 기준 계약이 되더라도 민간임대주택법상 과태료 대상인지는 따로 판정⁠합니다.

양도 전에 확인할 것

  • 등록 전 계약일, 임대사업자 등록일(지자체⁠·⁠세무서), 등록 유형(단기⁠·⁠장기일반, 변경 등록 여부)
  • 등록 시점 계약을 등록 전에 작성했는지 등록 후에 작성했는지(계약서 작성일과 등록증 등록일 대조)
  • 지자체에 제출한 표준임대차계약서의 금액이 실제 계약과 같은지
  • 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 처음 체결하거나 갱신한 계약의 날짜와 금액, 그 계약 뒤 모든 갱신의 증가율
  • 묵시적 갱신이 있었는지(갱신 계약서 없이 연장된 기간)
  • 2020⁠년 2⁠월 11⁠일 이후 계약의 1⁠년 안 재증액 여부, 보증금⁠·⁠월세 전환 계산 내역
  • 받으려는 특례가 거주주택 비과세⁠·⁠중과배제인지, 장기보유특별공제 특례인지, 종부세 합산배제인지

자주 묻는 질문

Q. 2018⁠년에 등록하면서 보증금을 10% 증액했으면 거주주택 비과세를 못 받나요?

A. 그 계약이 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전에 체결된 것이면 소득세법 시행령의 5% 요건을 적용하지 않습니다(부칙 제29523⁠호 제6⁠조). 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 처음 체결⁠·⁠갱신한 계약이 기준이 되고, 그다음 계약부터 5% 이내인지 봅니다(서면-2020-부동산-3300).

Q. 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 첫 갱신 때 5%⁠를 넘겨 증액했으면요?

A. 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 전에 등록한 주택이면 거주주택 비과세⁠·⁠중과배제에서는 그 첫 갱신 계약이 기준 계약이 되고 다음 계약부터 5%⁠를 비교합니다. 장기보유특별공제 특례는 장기일반으로 등록한 후 작성한 계약이 기준이므로 등록 후 계약 대비 5%⁠를 넘겼다면 요건을 충족하지 못합니다(서면-2020-부동산-1528).

Q. 종부세 합산배제도 같은 날을 기준으로 보나요?

A. 네. 종합부동산세법 시행령의 5% 요건도 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 갱신하거나 새로 체결하는 계약분부터 적용하고(부칙 제29524⁠호 제3⁠조), 그 이후 최초로 체결⁠·⁠갱신한 표준임대차계약을 기준으로 봅니다(서면-2019-부동산-3588). 2019⁠년 2⁠월 12⁠일 이후 장기일반으로 등록했다면 등록 후 작성한 계약을 기준으로 본 회신도 있습니다(서면-2021-부동산-5682).

Q. 세법상 문제가 없으면 과태료도 없나요?

A. 아닙니다. 민간임대주택법의 증액 제한은 세법 요건과 따로 적용하므로 과태료 대상인지는 별도로 판정합니다.

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본 칼럼은 일반적인 세무 정보 제공을 목적으로 하며 개별 사안에 대한 세무 자문이 아닙니다. 작성일(2026-11-12) 기준 법령에 따른 것이며, 구체적인 판단은 상담을 통해 확인하시기 바랍니다.
세무사 장민 · 와이제이 택스 라운지
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