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기타최종 검토 2026-11-12

폐업한 개인사업자의 오래된 체납액, 납부의무 소멸특례를 받을 수 있나

"몇 년 전 가게를 접었는데 그때 못 낸 부가가치세가 아직 남아 있습니다. 체납액을 없애 주는 제도가 생겼다는데 저도 되나요?" 2026⁠년부터 신청을 받는 생계형체납자 납부의무 소멸특례⁠는 모든 사업을 폐업한 거주자의 2025⁠년 1⁠월 1⁠일 이전에 발생한 종합소득세⁠·⁠부가가치세 체납액 가운데 징수가 곤란한 금액의 납부의무를 소멸시킵니다. 신청 기간은 2028⁠년 12⁠월 31⁠일까지이고, 소멸은 신청한 날이 아니라 세무서장이 결정해 통지한 날에 됩니다. 2026⁠년 11⁠월 현재 법령 기준입니다.

조문이 정한 대상과 효과

조세특례제한법 제99⁠조의15⁠는 2026⁠년 1⁠월 1⁠일 이후 신청하는 분부터 적용하는 새 제도입니다. 제1⁠항 본문이 대상 체납액과 효과를 함께 정합니다.

관할 세무서장은 다음 각 호의 요건을 모두 갖춘 거주자에 대하여 제1⁠호에 따른 실태조사 결과 해당 거주자로부터 징수가 곤란하다고 인정되는 2025⁠년 1⁠월 1⁠일 이전에 발생한 체납액으로서 종합소득세(이에 부가되는 농어촌특별세를 포함한다), 부가가치세, 종합소득세 및 부가가치세에 부가되는 가산세(가산금을 포함한다)ㆍ강제징수비 중 국세징수권 소멸시효가 완성되지 아니한 금액(이를 모두 합친 금액을 이하 이 조에서 "소멸대상체납액"이라 한다)⁠의 납부의무를 소멸시킬 수 있다.

조세특례제한법 제99⁠조의15 제1⁠항 본문

문언이 "소멸시킬 수 있다"이므로 요건을 갖췄다고 체납액이 저절로 소멸하지 않습니다. 실태조사를 거쳐 세무서장이 징수가 곤란하다고 인정한 금액⁠만 소멸합니다.

구분소멸 대상 여부
종합소득세, 이에 부가되는 농어촌특별세대상
부가가치세대상
위 세목의 가산세(가산금 포함), 강제징수비대상
양도소득세, 종합부동산세, 원천징수 세액 등 다른 국세조문에 없어 대상 아님
개인지방소득세지방세라 이 조문 대상 아님
소멸시효가 이미 완성된 금액이미 납부의무가 소멸해 대상 아님

국세징수권 소멸시효가 완성되면 그때 납부의무가 소멸합니다(국세기본법 제26⁠조 제3⁠호). 시효는 가산세를 뺀 국세가 5⁠억원 이상이면 10⁠년, 그 밖에는 5⁠년입니다(같은 법 제27⁠조 제1⁠항). 다만 납부고지·독촉·교부청구·압류로 시효가 중단되고, 분납기간⁠·⁠징수 유예기간 등에는 진행하지 않습니다(같은 법 제28⁠조). 그래서 오래된 체납액이라도 압류 등으로 시효가 중단됐다면 아직 시효가 완성되지 않아 이 특례의 대상이 될 수 있습니다. 개인지방소득세는 지방세특례제한법에 이 특례와 연동한 소멸 조문이 없습니다. 조세특례제한법 제99⁠조의10 징수특례에 개인지방소득세 징수특례(지방세특례제한법 제167⁠조의4)⁠가 따로 있는 것과 다릅니다.

2025⁠년 1⁠월 1⁠일 이전에 발생한 체납액

국세징수법은 "체납"을 국세를 지정납부기한까지 납부하지 않은 것으로 정합니다(국세징수법 제2⁠조 제1⁠항 제2⁠호). 신고만 하고 납부하지 못한 세금은 세무서가 납부고지를 하고 그 고지서의 납부기한이 지나야 체납이 됩니다. 종전 소멸특례(제99⁠조의5)⁠에 대한 국세청 회신도 납세고지서 등으로 지정한 납부 시한까지 납부하지 않으면 체납된다고 보았습니다. 같은 회신은 기준일 현재 체납액이 있는지는 관할 세무서장이 사실관계를 확인해 판단한다는 단서도 붙였습니다(서면-2018-징세-4122, 2019.4.23.).

이 정의대로 읽으면 지정납부기한이 2025⁠년 1⁠월 1⁠일 이후인 고지분⁠은 이 특례의 대상이 아닌 것으로 읽힙니다. 예를 들어 2024⁠년 귀속 종합소득세를 확정신고하고 납부하지 못한 금액은 고지서의 납부기한이 2025⁠년 이후에 도래하므로 이 독법에서는 대상에서 제외됩니다. 다만 2024⁠년 11⁠월 30⁠일이 기한인 종합소득세 중간예납세액이나 2024⁠년 중 기한이 지난 부가가치세 예정고지세액을 그 기한까지 납부하지 못했다면 그 부분은 2024⁠년에 이미 체납된 금액일 수 있습니다(국세징수법 제2⁠조 제2⁠항). 생계형 특례에서 "발생"을 체납 시점으로 볼지 납세의무 성립 시점으로 볼지 밝힌 해석은 아직 찾지 못했습니다. 경계에 걸리는 체납액은 신청 전에 관할 세무서 징세과에 건별로 확인합니다.

신청하려면 갖춰야 할 6⁠가지 요건

제1⁠항 각 호는 모두 갖춰야 합니다. 제1⁠호·제2⁠호·제4⁠호·제5⁠호의 판단 기준일은 신청일이 아니라 실태조사일입니다. 세무서장은 신청을 받은 날의 다음 날부터 실태조사를 시작한 것으로 봅니다(조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제5⁠항). 따라서 폐업 신고는 신청 전에 마쳐 두는 것이 안전합니다.

요건조문 문언확인할 것
1⁠호 폐업⁠·⁠경제적 어려움실태조사일 이전에 모든 사업을 폐업, 실태조사 결과 경제적 어려움으로 납부가 곤란하다고 인정사업장이 여럿이면 전부 폐업
2⁠호 금액실태조사일 현재 소멸대상체납액 5⁠천만원 이하다른 세무서에서 이미 소멸된 금액 포함
3⁠호 수입금액최종 폐업일이 속하는 과세연도 포함 직전 3⁠개 과세연도 사업소득 총수입금액 평균 15⁠억원 미만1⁠년 미만 과세연도는 1⁠년으로 환산
4⁠호 처벌⁠·⁠재판실태조사일 직전 5⁠년 이내 조세범 처벌법에 따른 처벌⁠·⁠처분 사실이나 관련 재판 진행 사실 없음재판 진행 중도 해당
5⁠호 조사실태조사일 현재 조세범 처벌법에 따른 범칙사건 조사 진행 사실 없음범칙사건 조사 여부
6⁠호 종전 특례제99⁠조의5 영세개인사업자 소멸특례를 받은 사실 없음2018~2019⁠년 신청 이력

제3⁠호의 15⁠억원은 조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제1⁠항이 정합니다.

국세청 안내문은 범칙 요건을 "처벌⁠·⁠처분 받은 사실이 없고 조사가 진행 중이지 않을 것"으로 줄여 썼습니다. 조문 제4⁠호에는 관련 재판이 진행 중인 사실⁠도 들어 있으므로 재판이 진행 중이면 요건을 갖추지 못합니다. 5⁠천만원 한도도 안내문은 "여러 세무서에 있는 경우 합계"로 판단한다고 썼습니다. 조문 제2⁠호 괄호는 여기에 더해 다른 세무서에서 이미 납부의무가 소멸된 소멸대상체납액도 모두 포함해 계산한다고 정합니다.

징수가 곤란한 체납액은 재산을 빼고 계산합니다

소멸하는 금액은 징수가 곤란하다고 인정되는 금액에 한정됩니다. 제2⁠항이 든 경우는 네 가지입니다.

  1. 실태조사일 현재 재산이 없어 해당 거주자의 체납액을 징수할 수 없는 경우 그 체납액
  2. 실태조사일 현재 체납처분(또는 강제징수)⁠이 종결되고 해당 거주자의 체납액에 충당된 배분금액이 그 체납액에 미치지 못하는 경우 배분금액을 충당하고 남은 체납액
  3. 실태조사일 현재 총재산가액이 강제징수비에 충당하고 남을 여지가 없어 해당 거주자의 체납액을 징수할 수 없는 경우 그 체납액
  4. 그 밖에 징수가 곤란하다고 인정되는 경우로서 대통령령으로 정하는 체납액
조세특례제한법 제99⁠조의15 제2⁠항

제4⁠호의 체납액은 조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제2⁠항의 산식으로 계산합니다. 체납액에서 실태조사일 현재 징수할 수 있는 재산을 상속세 및 증여세법 제60⁠조부터 제66⁠조까지로 평가한 금액의 100⁠분의 140⁠을 빼고, 체납된 국세의 법정기일 전에 등기⁠·⁠등록된 전세권⁠·⁠질권⁠·⁠저당권으로 담보된 채권이나 확정일자를 갖춘 임대차계약서상의 보증금을 더합니다. 이 보증금은 체납자 재산을 빌린 임차인의 보증금입니다(국세기본법 제35⁠조 제1⁠항 제3⁠호). 재산이 조금 있어도 평가액의 140%⁠에서 선순위 담보채권⁠·⁠보증금을 뺀 금액만 징수할 수 있는 금액으로 남기고 나머지를 징수가 곤란한 체납액으로 봅니다.

가정 사례

폐업한 개인사업자의 체납액이 부가가치세⁠·⁠종합소득세 본세 3,000⁠만원, 가산세 700⁠만원으로 모두 2024⁠년 12⁠월 31⁠일 이전에 지정납부기한이 지났습니다. 실태조사일 현재 재산은 차량과 예금이며, 차량에는 체납 국세의 법정기일 전에 등록된 저당권이 있습니다(가정 수치).

항목금액비고
체납액3,700⁠만원본세 3,000⁠만원, 가산세 700⁠만원
재산 평가액500⁠만원차량 300⁠만원, 예금 200⁠만원
빼는 금액700⁠만원재산 평가액의 140%
더하는 금액200⁠만원차량에 법정기일 전 등록된 저당권 채권
징수곤란 체납액3,200⁠만원3,700⁠만원 − 700⁠만원 + 200⁠만원

3,200⁠만원은 5⁠천만원 이하이므로 제2⁠호 요건을 갖춥니다. 나머지 500⁠만원은 소멸하지 않아 계속 납부해야 합니다. 일부만 소멸할 때는 건별로 소멸시키고 그 순서는 거주자가 신청한 순서에 따르며, 순서를 정하지 않았으면 국세징수권 소멸시효가 많이 남은 건부터 소멸시킵니다(조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제8⁠항, 제99⁠조의5 제6⁠항).

재산을 어떻게 평가하느냐에 따라 소멸액이 달라집니다. 종전 제99⁠조의5 특례에서 국세청은 보험사고가 아직 발생하지 않은 보장성 보험은 해지하면 받을 해지환급금 상당액으로 평가한다고 회신했습니다(서면-2018-법령해석기본-3915, 2019.5.31.). 생계형 특례에도 같은 평가 조문(상속세 및 증여세법 제60⁠조~제66⁠조)⁠을 쓰지만 생계형 특례를 직접 다룬 해석은 확인되지 않습니다.

신청부터 소멸까지

생계형체납자 납부의무 소멸 절차
  1. 2026.1.1.~2028.12.31.
    신청
    소멸대상체납액을 관할하는 세무서장에게 신청서 제출
  2. 신청일 다음 날
    실태조사 시작
    신청받은 날의 다음 날부터 실태조사를 시작한 것으로 봄
  3. 실태조사 중
    소명 요구
    재산 확인 등이 필요하면 10⁠일 이내 기간을 정해 소명 요구
  4. 신청일부터 6⁠개월 이내
    결정⁠·⁠통지
    국세체납정리위원회 심의 후 결정, 소명기간⁠·⁠재산평가기간은 6⁠개월에 포함하지 않음
  5. 통지한 날
    소멸
    소멸 결정을 통지한 날에 납부의무가 소멸한 것으로 봄
  6. 결정 후
    취소
    실태조사일 당시 다른 재산이 있었던 것을 발견하면 그 재산 가액만큼 취소

신청 기간과 결정 절차는 제3⁠항⁠·⁠제4⁠항, 실태조사 개시⁠·⁠소명⁠·⁠기간 계산은 조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제5⁠항부터 제7⁠항까지에 있습니다. 거동이 불편하거나 질병⁠·⁠부상 등으로 입원 또는 장기 요양 중이어서 직접 신청이 어려우면, 담당 공무원이 거주자의 동의를 얻어 대신 신청할 수 있습니다(제3⁠항 단서, 조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14 제4⁠항).

국세청 안내에 따르면 신청은 홈택스(증명⁠·⁠등록⁠·⁠신청 → 세금관련 신청⁠·⁠신고 공통분야 → 체납 관련 신청 → 생계형 체납자의 납부의무소멸 신청)⁠나 전국 세무서 징세과에서 할 수 있고, 실태조사 때는 주소지 등을 방문해 생활실태와 체납원인⁠·⁠납부능력을 확인합니다.

세무서장은 제4⁠항에 따라 소멸대상체납액에 대하여 납부의무의 소멸을 결정한 후에도 실태조사일 당시 징수할 수 있는 다른 재산이 있었던 것을 발견한 때에는 지체 없이 그 재산의 가액에 상당하는 금액에 대하여 납부의무의 소멸을 취소하고 체납처분(또는 강제징수)⁠을 하여야 한다.

조세특례제한법 제99⁠조의15 제5⁠항

취소 사유는 실태조사일 당시⁠에 이미 있던 재산입니다. 취소하는 금액도 그 재산의 가액에 상당하는 금액까지입니다. 실태조사 때는 재산을 빠짐없이 밝힙니다.

종전 소멸특례⁠·⁠체납액 징수특례와 무엇이 다른가

체납 개인사업자를 위한 조세특례제한법 특례는 세 가지입니다.

구분대상효과
제99⁠조의5 영세개인사업자 소멸특례2017.12.31. 이전 폐업 후 2018⁠년 재창업⁠·⁠취업, 신청기간 2018.1.1.~2019.12.31.1⁠명당 3⁠천만원 한도 소멸, 신청기간 종료
제99⁠조의10 체납액 징수특례2025.12.31. 이전 모든 사업 폐업 후 재창업⁠·⁠취업⁠·⁠노무제공, 체납 8⁠천만원 이하, 신청기간 2029.12.31.까지납부지연가산세 면제, 5⁠년 이내 분납
제99⁠조의15 생계형체납자 소멸특례실태조사일 이전 모든 사업 폐업, 경제적 어려움, 신청기간 2026.1.1.~2028.12.31.소멸대상체납액 5⁠천만원 이하 소멸

다시 사업을 시작했거나 취업해 소득이 발생한다면 제99⁠조의10 징수특례를, 폐업 뒤 납부 능력이 없는 상태라면 제99⁠조의15 소멸특례⁠를 봅니다. 제99⁠조의10 제1⁠항 제6⁠호는 제99⁠조의5⁠나 제99⁠조의15 소멸특례를 받은 사실이 없는 사람⁠만 징수특례를 받게 하므로 생계형 소멸특례를 적용받은 뒤에는 징수특례를 적용받을 수 없습니다. 반대로 제99⁠조의15 제1⁠항 제6⁠호는 제99⁠조의5 소멸특례를 받은 적이 없을 것만 요구합니다. 징수특례를 받았던 사람이 생계형 소멸특례를 신청하는 것은 문언상 배제되지 않습니다.

신청 전에 확인할 것

  1. 홈택스 체납 내역에서 세목이 종합소득세⁠·⁠부가가치세(가산세⁠·⁠강제징수비 포함)⁠인지, 건별 지정납부기한이 2024⁠년 12⁠월 31⁠일 이전인지 확인합니다.
  2. 건별 소멸시효가 이미 완성됐는지 확인합니다. 압류⁠·⁠독촉 이력이 있으면 시효가 중단됐을 수 있습니다.
  3. 모든 사업장의 폐업 신고를 마쳤는지 확인합니다.
  4. 최종 폐업일이 속하는 과세연도를 포함한 직전 3⁠개 과세연도의 사업소득 총수입금액 평균이 15⁠억원 미만인지 확인합니다.
  5. 조세범 처벌법에 따른 처벌⁠·⁠처분, 진행 중인 재판이나 범칙사건 조사가 있는지 확인합니다.
  6. 2018~2019⁠년에 제99⁠조의5 소멸특례를 받은 적이 있는지 확인합니다.
  7. 예금·보험·차량·임차보증금 등 실태조사일 현재 재산 목록과, 그 재산에 설정된 저당권⁠·⁠전세권이나 체납자 소유 건물 임차인의 확정일자 보증금을 정리합니다.

자주 묻는 질문

Q. 신청하면 그날부터 체납액이 없어지나요?

A. 아닙니다. 세무서장이 국세체납정리위원회 심의를 거쳐 소멸하기로 결정하고 통지한 날에 소멸한 것으로 봅니다(조세특례제한법 제99⁠조의15 제4⁠항). 결정은 신청일부터 6⁠개월 이내에 하되 소명기간과 재산평가기간은 그 6⁠개월에 포함하지 않습니다.

Q. 폐업 전에 체납된 양도소득세도 함께 없어지나요?

A. 소멸하지 않습니다. 조세특례제한법 제99⁠조의15⁠가 정한 세목은 종합소득세(농어촌특별세 포함)⁠와 부가가치세, 그 가산세⁠·⁠강제징수비뿐입니다. 양도소득세 등 다른 국세 체납액은 그대로 납부해야 합니다.

Q. 체납액이 5⁠천만원을 넘으면 신청할 수 없나요?

A. 5⁠천만원은 전체 체납액이 아니라 소멸대상체납액, 곧 대상 세목 중 징수가 곤란하다고 인정되는 금액을 기준으로 합니다(조세특례제한법 제99⁠조의15 제1⁠항 제2⁠호). 다른 세무서에서 이미 소멸된 금액도 더해 계산합니다. 대상이 아닌 세목의 체납액은 이 한도 계산에 들어가지 않는 것으로 읽힙니다.

Q. 소멸 결정을 받은 뒤 재산이 생기면 다시 징수하나요?

A. 조세특례제한법 제99⁠조의15 제5⁠항은 실태조사일 당시 징수할 수 있는 다른 재산이 있었던 것을 나중에 발견한 때를 취소 사유로 정합니다. 그 재산의 가액에 상당하는 금액만 취소하고 강제징수합니다. 실태조사일 뒤에 새로 취득한 재산을 취소 사유로 정한 문언은 제5⁠항에 없습니다. 종전 영세개인사업자 소멸특례(조세특례제한법 제99⁠조의5)⁠는 사업자등록을 신청한 뒤 1⁠개월 안에 사업자등록증을 받지 못하거나 사업을 시작하지 않은 경우의 취소 사유(제6⁠항)⁠와 2017⁠년 7⁠월 1⁠일 이후 취득한 재산에 대한 체납처분 규정(제7⁠항⁠·⁠제8⁠항)⁠을 따로 두었습니다. 제99⁠조의15⁠에는 이런 항이 없습니다.

근거 법령

  • 조세특례제한법 제99⁠조의15, 제99⁠조의5, 제99⁠조의10 제1⁠항 제6⁠호
  • 조세특례제한법 시행령 제99⁠조의14, 제99⁠조의5 제6⁠항
  • 국세기본법 제26⁠조 제3⁠호, 제27⁠조 제1⁠항, 제28⁠조
  • 국세징수법 제2⁠조 제1⁠항 제2⁠호⁠·⁠제4⁠호, 제106⁠조
  • 서면-2018-징세-4122(2019.4.23.), 서면-2018-법령해석기본-3915(2019.5.31.)
본 칼럼은 일반적인 세무 정보 제공을 목적으로 하며 개별 사안에 대한 세무 자문이 아닙니다. 작성일(2026-11-12) 기준 법령에 따른 것이며, 구체적인 판단은 상담을 통해 확인하시기 바랍니다.
세무사 장민 · 와이제이 택스 라운지
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